DNAシーケンシング| デオキシリボ核酸– DNA

DNAシークエンシング

DNA配列決定では、生化学的方法を使用して、DNA分子内のヌクレオチド(糖とリン酸を含むDNA塩基分子)の配列を決定します。 最も広く使用されている方法は、サンガーチェーンターミネーション法です。 DNAはXNUMXつの異なる塩基で構成されているため、XNUMXつの異なるアプローチが行われます。

各アプローチには、シーケンスされるDNA、プライマー(シーケンスの開始分子)、DNAポリメラーゼ(DNAを拡張する酵素)、およびXNUMXつの必要なヌクレオチドすべての混合物が含まれます。 ただし、これらXNUMXつのアプローチのそれぞれで、異なる塩基が化学的に修飾されているため、組み込むことができますが、DNAポリメラーゼの作用点は提供されません。 これにより、チェーンが終了します。 この方法では、さまざまな長さのDNAフラグメントが生成され、その長さに応じて、いわゆるゲル電気泳動によって化学的に分離されます。 得られたソーティングは、各塩基を異なる蛍光色で標識することにより、配列決定されたDNAセクションのヌクレオチド配列に変換できます。

DNAハイブリダイゼーション

DNAハイブリダイゼーションは、異なる起源のDNAのXNUMXつの一本鎖間の類似性を証明するために使用される分子遺伝学的方法です。 この方法は、DNA二本鎖が常にXNUMX本の相補的な一本鎖で構成されているという事実を利用しています。 両方の一本鎖が互いに類似しているほど、より多くの塩基が反対の塩基との強固な接続(水素結合)を形成するか、より多くの塩基対が形成されます。

異なる塩基配列を持つXNUMXつのDNA鎖のセクション間で塩基のペアリングは発生しません。 化合物の相対数は、新しく形成されたDNA二本鎖が分離される融点を決定することによって決定できます。 融点が高いほど、より多くの相補的な塩基が互いに水素結合を形成し、XNUMXつの一本鎖がより類似しています。 この方法は、DNA混合物中の特定の塩基配列を検出するためにも使用できます。この目的のために、人工的に形成されたDNAフラグメントを(蛍光)色素で標識することができます。 これらは、対応する塩基配列をマークするのに役立ち、したがってそれを可視化することができます。