コロナウイルスの変異

突然変異は普通にある

新しいウイルス変異体の出現は珍しいことではありません。Sars-CoV-2 病原体を含むウイルスは、複製中に遺伝物質をランダムに繰り返し変化させます。これらの突然変異のほとんどは無意味です。しかし、中にはウイルスにとって有利で定着するものもある。

このようにして、ウイルスは環境とその宿主に迅速に適応できます。これは彼らの進化戦略の一部です。

WHO は、新しい亜種を次のカテゴリに従って分類しています。

監視中の変異体 (VBM) – より高いリスクを意味する可能性があるが、影響がまだ不明な遺伝子変化を伴う変異体。
対象変異体 (VOI): 以前の型と比較して、より高い伝染性、免疫や診断検査の回避、またはより重篤な疾患を予測する遺伝的特徴を持つ変異体。
重大な結果をもたらす変異体 (VOHC) – 重大な結果をもたらす変異体: 現在のワクチンでは防御できない変異体。現在までに、このカテゴリーに SARS-CoV-2 の変異体は存在しません。

ウイルスの変異は、いわゆるクレードまたは系統に分類されます。このため、研究者は「コロナウイルスの家系図」を体系的に記録し文書化します。各変異体はその遺伝的特性に従って特徴付けられ、文字と番号の組み合わせが割り当てられます。ただし、この指定は、特定のウイルス株が他のウイルス株よりも危険かどうかを示すものではありません。

コロナウイルスはどう変化するのか？

コロナウイルスが「うまく」進化するには XNUMX つの方法があります。人間の細胞に侵入しやすくなり、より感染力が高まるように変化するか、または次のような適応を行って免疫システムから「逃れよう」とします。

エスケープ変異: これらは、コロナウイルスが免疫システムから「逃れる」ことを可能にする変化です。その後、ウイルスはその外部の形状を変化させ、最初の感染またはワクチン接種の抗体（すでに形成されている）がウイルスを「認識」して中和することができなくなります。これは「エスケープ突然変異」または「免疫エスケープ」とも呼ばれます。したがって、二次感染の可能性がさらに高まる可能性があります。

ウイルスの亜種はどのようにして発生するのでしょうか?

パンデミックが長引けば長引くほど、感染者数が増加し、コロナウイルスの変異や変異も増加します。

コロナのパンデミックは 05 年間続いています。2022 年 296 月 XNUMX 日の時点で、ジョンズ・ホプキンス大学コロナウイルス・リソース・センター (CRC) は、世界中で約 XNUMX 億 XNUMX 万人の感染者を報告しています。

コロナウイルスが遺伝物質に複数の変化（変異）を蓄積するのに十分な機会。

これらの膨大な数の症例、およびそれに伴う Sars-CoV-2 の遺伝子変化は、現在、多数の新しいウイルス変異種の大規模な蔓延に反映されています。

デルタ: B.1.617.2 リネージ

Sars-CoV-1.617.2 のデルタ変異体 (B.2) も、ここ数カ月 (2021 年秋) にドイツで急速に蔓延しました。最初にインドで発見され、いくつかの特徴的な変化を組み合わせた XNUMX つの亜変種に分かれています。

一方では、これらは人間の細胞の「鍵」と考えられているスパイクタンパク質の変化です。一方、B.1.617 も、(可能性のある) 回避突然変異として議論されている変化を示しています。

具体的には、B.1.617 は、特に次の関連する変異を組み合わせています。

変異D614G: コロナウイルスの感染力を高める可能性があります。初期のモデリングでは、これによって B.1.617 が少なくとも感染力の高いアルファ亜種 (B.1.1.7) と同じくらい簡単に感染することが示唆されています。

変異 P681R: 研究者らは、毒性の増加の可能性についても関連付けています。

変異 E484K: ベータ変異体 (B.1.351) およびガンマ変異体 (P.1) でも見つかっています。すでに形成されている中和抗体に対するウイルスの感受性が低下すると考えられています。

変異 L452R: エスケープ変異の可能性としても議論されています。 L452R変異を持つコロナウイルス株は、実験室実験で特定の抗体に対して部分的に耐性を示した。

これまでヨーロッパで優勢だったデルタ変異体も、感染力の高いオミクロン変異体に大きく取って代わられているようです。

Omikron: B.1.1.529 リネージ

オミクロン変異株は、2021年XNUMX月にボツワナで初めて発見された最新のコロナウイルス変異株である。現在、世界保健機関（WHO）によって懸念される新規変異株として正式に分類されている。

エリス：EG.5の系譜

コロナウイルスのEG.5変異体はOmikron系統に由来します。このウイルスは、2023 年 XNUMX 月に初めて検出されました。それ以来、世界中のさまざまな国に広がり、多くの場所で感染シーンを支配しています。不和と争いを司るギリシャの女神にちなんでエリスとも呼ばれます。

EG.5 は、ミクロンのバリアント XBB.1.9.2 から派生したものです。および XBB.1.5 と同様ですが、スパイクタンパク質 (F456L) にも新しい変異があります。 EG.5.1 亜系統には、さらに別の Q52H 変異も含まれています。

EG.5 は以前の亜種よりも危険ですか?

EG.5の出現により、コロナ感染者数が再び増加しており、それに伴い入院者数も増加している。 WHOによると、これまでのところ病気の重症度に変化は報告されていない。したがって、WHOはEG.5を関心のある変異体(VOI)として分類しましたが、懸念される変異体(VOC)には分類しませんでした。

秋の対応ブースターワクチンは、正確には EG.5 を標的としていませんが、密接に関連するウイルス系統 (XBB.1.5) を標的としています。初期の臨床研究では、追加ワクチン接種がEG.5に対しても有効であることが示されています。

ピローラ: BA.2.86 系統

BA.2.86 ウイルスの亜種も、オーミクロンの派生型です。これは、スパイクタンパク質に 2 個の新たな変異があるという点で、その推定上の前任者であるバリアント BA.34 とは異なり、最近の Omicron と同様に初期の型から分岐しています。

BA.2.86 はどのくらい一般的ですか?

これまでのところ、この変異型は少数の人にしか見つかっていない。ただし、全体的にはほとんどテストが行われていません。特に、特定のウイルス変異体を判定する精緻な検査はまれです。既知の症例が XNUMX つの大陸 (北米、アジア、ヨーロッパ) から発生しており、直接の関連性がないという事実は、ピローラがすでに気づかれないうちに蔓延していることを示唆しています。

BA.2.86 は以前の亜種よりも危険ですか?

適応されたワクチンは BA.2.86 に対して有効ですか?

1.5 月から入手可能なワクチンは、XBB.36 バリアント用に最適化されています。そのスパイクタンパク質は、ピローラのスパイクタンパク質と XNUMX の部分で異なります。したがって、感染に対する防御力が低下する可能性があります。しかし、専門家は、厳しい進路に対する保護はまだ残っていると考えています。

その他の既知のウイルス亜種

野生型とは異なる追加の Sars-CoV-2 ウイルス変異体も開発されていますが、専門家は現在それらを VOC として分類していません。これらのウイルス株は「対象変異体」（VOI）と呼ばれます。

これらの新興VOIがパンデミックにどのような影響を与える可能性があるかはまだ明らかではありません。それらがすでに流行しているウイルス株に対して主張し、勝利した場合、それらも対応する VOC にアップグレードされる可能性があります。

特に興味深いバリアント

BA.4: オミクロンのサブタイプ。南アフリカで最初に発見されました。
BA.5: オミクロンのサブタイプ。南アフリカで最初に発見されました。

監視下にある変異

いわゆる「監視中の変異体」（VUM）が広範囲に焦点を当てていますが、これらに関する信頼できる体系的なデータは依然として不足しています。ほとんどの場合、それらが単に存在しているという証拠しか入手できません。これらには、散発的に発生する変異体だけでなく、既知の変異の「改変された」子孫も含まれます。

ECDC によると、現在、これらのまれな VUM には次のものが含まれます。

XD – フランスで最初に検出された変異種。
BA.3 – Omikron 亜種のサブタイプ。南アフリカで最初に検出されました。
BA.2 + L245X – 起源不明のミクロン変異体のサブタイプ。

ダウングレードされたウイルスの亜種

現在進行中のコロナパンデミックにおける感染事象がダイナミックに進化しているのと同じように、パンデミックのさまざまな段階で蔓延しているウイルス変異種の科学的理解と評価も進化しています。

アルファ: B.1.1.7 リネージ

当局者らによると、コロナウイルスの変異種アルファ（B.1.1.7）は、ヨーロッパではもうほとんど流行っていないという。アルファは英国で最初に検出され、2020年の秋以降、イングランド南東部から始まり、ヨーロッパ大陸全体にますます広がりを見せています。

B 1.1.7 系統には、17 個の変異があり、驚くほど多くの遺伝子変化がありました。これらの変異のいくつかは、N501Y 変異を含め、スパイクタンパク質に非常に大きな影響を与えました。

B.1.1.7 は野生型 Sars-CoV-35 よりも感染力が約 2% 高いと考えられており、感染による観察された死亡率 (事前のワクチン接種なし) も増加しました。しかし、利用可能なワクチンは強力な防御をもたらしました。

アルファは公的機関（ECDC、CDC、WHO）と一致して大幅に減少しています。

ベータ: B.1.351 リネージ

この変異株は、南アフリカの人口にウイルスが大量に蔓延した結果として発生した可能性が最も高い。南アフリカではすでに2020年の夏に大規模なコロナ発生が記録されている。特に郡部ではおそらくウイルスが飛躍的に蔓延する理想的な条件を見つけたのだろう。

これは、非常に多くの人がすでに元の型の Sars-CoV-2 に対して免疫を持っていたことを意味します。ウイルスは変化する必要がありました。研究者らはこのような状況を進化圧力と呼んでいます。その結果、元のウイルスよりも感染力が強いなどの理由で、新しいウイルスの変異種が蔓延しました。

予備データは、Comirnaty ワクチンが B.1351 系統に対しても高い有効性を持っていることを示唆しています。一方、著者Madhiらの予備声明によると、VaxZevriaは有効性が低下する可能性があるという。

公的機関（ECDC、CDC、WHO）との合意によれば、ベータ版は大幅に減少している。

ガンマ: P.1 ライン

P.1 と呼ばれる別の VOC (以前は B.1.1.28.1 として知られ、現在はガンマと呼ばれています) は、2020 年 1 月にブラジルで初めて発見されました。P.501 も、そのゲノムに重要な N1Y 変異を持っています。したがって、P.XNUMX ウイルス株は感染力が強いと考えられています。

ガンマはもともとアマゾン地域で進化し、広がりました。変異種の蔓延は、19年2020月中旬にこの地域で新型コロナウイルス感染症関連の入院者数が急増したのと一致している。

ECDC、CDC、WHOの専門家と一致して、ガンマ線は急激に減少しています。

さらに緩和された亜種

多数の新しいウイルスの亜種が知られるようになりましたが、これが自動的に脅威の増大を意味するわけではありません。このような変異株が（世界的な）感染率に及ぼす影響は小さいか、抑制されていました。これらには次のものが含まれます。

イプシロン: B.1.427 および B.1.429 – 最初にカリフォルニアで発見されました。
Eta: 多くの国で検出されました (B.1.525)。
シータ: 以前は P.3 に指定されていましたが、現在は格下げされており、フィリピンで最初に発見されました。
カッパ: インドで最初に検出されました (B.1.617.1)。
ラムダ: 2020 年 37 月にペルーで初めて発見されました (C.XNUMX)。
Mu: 2021 年 1.621 月にコロンビアで初めて発見されました (B.XNUMX)。
イオタ: 米国のニューヨーク都市圏で最初に発見されました (B.1.526)。
ゼータ: 以前は P.2 に指定されていましたが、現在は格下げされており、ブラジルで最初に発見されました。

Sars-CoV-2 はどれくらいの速さで変異しますか?

将来的に、Sars-CoV-2 は、突然変異を通じてヒトの免疫システムおよび（部分的に）ワクチン接種を受けた集団に適応し続けるでしょう。これがどれくらい早く起こるかは、主に現在感染している集団の規模に依存します。

地域的、国内的、国際的に感染症例が増えれば増えるほど、コロナウイルスはさらに増殖し、より頻繁に変異が発生します。

しかし、他のウイルスと比較すると、コロナウイルスは比較的ゆっくりと変異します。 Sars-CoV-2 ゲノムの全長は約 30,000 塩基対であるため、専門家は月に XNUMX ～ XNUMX 個の変異が発生すると想定しています。比較すると、インフルエンザウイルス（インフルエンザ）は同じ期間に XNUMX ～ XNUMX 倍の頻度で変異します。

コロナウイルスの変異株から身を守るにはどうすればよいですか?

個々のコロナウイルスの変異から身を守ることはできません。唯一の可能性は感染しないことです。

コロナウイルスの変異はどのように検出されるのでしょうか?

ドイツには、循環しているSars-CoV-2ウイルスを監視するための緊密な報告システムがあり、これは「統合分子監視システム」と呼ばれています。この目的を達成するために、関連する保健当局、ロベルトコッホ研究所 (RKI)、および専門の診断研究所が緊密に連携しています。

突然変異が疑われる場合、報告システムはどのように機能しますか?

まず第一に、専門的に実施されたすべての陽性コロナウイルス検査は、関連する公衆衛生部門への報告が義務付けられています。これには、検査センター、診療所、薬局、さらには学校などの政府施設で行われるコロナウイルス検査が含まれます。ただし、民間のセルフテストはこの限りではありません。

自己検査用のコロナウイルス迅速検査の詳細については、コロナ自己検査トピックの特集をご覧ください。

次に、RKI は報告されたデータと仮名化された形式の配列分析の結果を比較します。仮名化とは、個人について結論を導くことができないことを意味します。ただし、この情報は、医療システムの科学者や関係者が現在のパンデミックの状況の正確な概要を取得するためのデータ基盤を形成します。これにより、（必要に応じて）政策手段を導き出すために状況を可能な限り最善に評価することが可能になります。

シーケンスゲノム解析とは何ですか?

シーケンスゲノム解析は、詳細な遺伝子解析です。ウイルスゲノム内の個々の RNA 構成要素の正確な配列を検査します。これは、約2塩基対からなるSars-CoV-30,000ゲノムが解読され、野生型コロナウイルスのゲノムと比較できることを意味する。

この方法によってのみ、個々の変異を分子レベルで特定することができ、「コロナウイルス家系図」内での割り当てが可能になります。

これはまた、世界のすべての国が特定のコロナウイルス変異種の正確な蔓延を詳細に追跡できるわけではないことも明らかにしています。したがって、入手可能な報告データには不確実性が含まれる可能性があります。